দারুননাজাত সিদ্দীকিয়া কামিল মাদরাসা মূলত একটি আবাসিক শিক্ষা প্রতিষ্ঠান। আবাসিক ছাত্রদের জন্য রয়েছে বেশ কয়েকটি হল। প্রতিটি হল এক একটি এলাকা হিসেবে পরিচালিত। প্রতি এলাকা মাদরাসার দুজন শিক্ষক পরিচালকের সার্বিক তদারকিতে পরিচালিত। সব হল বা এলাকার সার্বিক পরিচালনার মূল দায়িত্ব পালন করেন স্বয়ং মহোদয়।